Accès pour assistants IA (serveur MCP)

Lecture seule, sans clé, sans compte.

Le Global Cell Atlas expose un serveur MCP pour que votre assistant interroge directement les marqueurs de types cellulaires, avec leurs références PubMed/DOI, leur classe Cell Ontology et les identifiants HGNC.

Adresse

https://atlas.kilianmaire.com/mcp (transport « Streamable HTTP », requêtes POST JSON-RPC)

Brancher votre client

• Claude (claude.ai ou application) : Paramètres → Connecteurs → Ajouter un connecteur personnalisé, puis collez l'adresse ci-dessus.
• Claude Code : claude mcp add --transport http global-cell-atlas https://atlas.kilianmaire.com/mcp
• Autre client MCP compatible HTTP : utilisez la même adresse.

Outils disponibles

• search_cell_types : recherche par nom, synonyme, tissu, gène marqueur ou identifiant Cell Ontology.
• get_cell_type : fiche d'un type avec ses marqueurs (spécifiques, positifs, négatifs), filtrables par espèce, modalité ou surface cellulaire.
• get_gene : dans quels types un gène est positif ou négatif, avec identifiants HGNC, Ensembl, UniProt.
• compare_cell_types : marqueurs propres et partagés de deux types.
• list_lineages : les 14 lignées et leurs types racines.

À savoir

• « Spécifique » est calculé sur la couverture de cet atlas : ce n'est pas une preuve d'exclusivité biologique ; vérifiez dans la littérature citée.
• Les données sont sous licence CC BY 4.0 : citez « Global Cell Atlas, KIMA Holding ».
• Pas de limite contractuelle, mais l'usage abusif (extraction massive automatisée) est interdit par les conditions d'utilisation.
• Aucune donnée personnelle n'est demandée ; voir la politique de confidentialité.